1- برنامه ریزی، هدایت و نظارت بر حسن اجرای مأموریتها و وظائف واحدهای دبیرخانه مجمع .
2- ایجاد هماهنگی و وحدت رويه بین فعالیت معاونتها با کمیسیونها و کمیته های دبیرخانه مجمع .
3– فراهم نمودن موجبات برنامه ای نمودن فعالیتهای دبیرخانه و تلفیق و راهبری برنامه ها در جهت اجرای بهینه مأموریتها و وظائف واحدهای دبیرخانه مجمع .
4– نظارت بر تهیه و تنظیم اعتبارات و بودجه پیشنهادی واحدهای دبیرخانه و راهبری و دفاع در مراجع ذیربط تا تصویب بودجه سالیانه مجمع .
5– ابلاغ مقررات، قوانین، آئین نامه ها و دستور العملهای مصوب و نظارت بر حسن اجرای آنها در واحدهای دبیرخانه مجمع .
6– ابلاغ دستورات رئیس و دبیر مجمع و پیگیری و نظارت بر حسن اجرای دستورات صادره .
7– نظارت و مراقبت بر چگونگی اجرای خط مشی ها و سیاستهای دبیر و رئیس مجمع در سطح دبیرخانه مجمع .
8– ابلاغ برنامه و بودجه سالیانه و نظارت بر اجرای بودجه سنواتی واحدهای دبیرخانه مجمع .
9- ارائه مشاوره به دبیر و رئیس مجمع .
10- نظارت و ایجاد هماهنگی بر نحوه تعامل کمیسیونهای تخصصی دبیرخانه با کمیسیونهای اصلی و صحن مجمع در راستای اجرای سیاستهای کلی نظام و رصد سند چشم انداز .
11- نظارت بر نحوه ارجاع و چگونگی بررسی موضوعات در کمیسیونهای تخصصی دبیرخانه مجمع مشتمل بر : موارد اختلافی میان مجلس شورای اسلامی و شورای نگهبان، استفساریه ها، معضلات نظام و گزارشهای نظارتی و اعلام نقطه نظرهای دبیر مجمع به کمیسیونهای مذکور .
12- نظارت بر نحوه تعامل و همکاری واحدهای دبیرخانه با سازمانها، نهادها و مجامع بین المللی حسب نظر دبیر مجمع .
13- نظارت بر تهیه و تدوین گزارش عملکرد واحدهای مختلف دبیرخانه و اعلام مراتب به دبیر و رئیس مجمع .
14– نظارت بر عملکرد و پیشرفت پروژه های علمی و تحقیقاتی کمیسیونهای دبیرخانه و معاملات کمیسیونها .
15- نظارت بر ایفای وظائف و مسئولیتهای اداری و مالی دبیرخانه مجمع در حیطه اختیارات تفویض شده از سوی رئیس و دبیر مجمع .
16- نظارت بر مراحل مختلف انعقاد قراردادهای پشتیبانی و پیمانکاری و انجام معاملات .
17– نظارت بر انتشار اسناد و گزارشهای و بررسیهای علمی و پژوهشی .
18- انجام ساير اموري كه از طريق مقام مافوق ارجاع مي گردد .